中央宣佈明年軍公教調薪3%，本縣未獲補助，縣府雖於當下隨即召開記者會表達嚴正抗議，並二度行文行政院要求予以補助，並協調省政府翁秘書長及縣籍楊立委在中央及立院發聲爭取，亦同步請監察院協助爭取，但均未獲行政院同意予以補助。
11月28日陳縣長為此特別率主計處及民政處處長親赴行政院主計總處，要求中央應予金門縣一合理公平的對待。經朱主計長說明，近年中央對地方政府調整待遇之補助，係納入一般性補助款設算機制，以基本財政收支有無差短為基準決定補助與否，本縣因基本財政收支無差短故無法予以補助，這是自民國88年以來一般性補助款之設算機制，各縣市應一體遵循。
惟朱主計長仍肯定本縣在財政上所做的努力，雖因既有的機制無法在公務員加薪乙案給予本縣補助，但請本縣另行提報具體的補助計畫，中央將會全力支持，以彌補本縣無法在加薪乙案上應得的補助額度。
